《蚌埠医学院学报》由安徽省教育厅主管，蚌埠医学院主办，面向国内外征稿和发行的综合性医学术期刊。由学报编辑委员会编辑、学报编辑部出版。学报编辑委员会由46位专家组成，负责审定论文的学术质量，主编祝延教授。
是中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)、中国学术期刊综合评价数据库(Chinese Academic Journal Comprehensive Evaluation Database, CAJCED)统计源期刊。中国科技论文与引文数据库(Chinese Science and Technology Paper and Citation Database ，CSTPC)、中国期刊全文数据库(Chinese Journal Full-text Database, CJFD)、中国核心期刊(遴选)数据库、中国生物医学光盘数据库(CBMdisc)、中文生物医学期刊文献数据库(CMCC)、中文科技资料目录-医药卫生、中国生物学文献数据库、《中国生物学文摘》和中国医学文摘(十余种)等收录本学报。已进入美国化学文摘(CA)、俄罗斯文摘杂志(AJ)等国际著名检索系统。
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